MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aggregatibacter aphrophilus NJ8700 chromosome

Total Repeats: 47764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012913	GA	3	6	239108	239113	50 %	0 %	50 %	0 %	251792050
5002	NC_012913	TTG	2	6	239195	239200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_012913	AGG	2	6	239225	239230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_012913	AGG	2	6	239235	239240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_012913	T	6	6	239244	239249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_012913	ATCA	2	8	239280	239287	50 %	25 %	0 %	25 %	251792051
5007	NC_012913	AAC	2	6	239307	239312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251792051
5008	NC_012913	GTT	2	6	239381	239386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251792051
5009	NC_012913	GGTC	2	8	239465	239472	0 %	25 %	50 %	25 %	251792051
5010	NC_012913	CCG	2	6	239602	239607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251792051
5011	NC_012913	TTGG	2	8	239739	239746	0 %	50 %	50 %	0 %	251792051
5012	NC_012913	CGG	2	6	239786	239791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251792051
5013	NC_012913	T	6	6	239823	239828	0 %	100 %	0 %	0 %	251792051
5014	NC_012913	ACC	2	6	239871	239876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251792051
5015	NC_012913	T	6	6	239912	239917	0 %	100 %	0 %	0 %	251792051
5016	NC_012913	GCC	2	6	239949	239954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251792051
5017	NC_012913	TAA	2	6	240030	240035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251792051
5018	NC_012913	CG	3	6	240038	240043	0 %	0 %	50 %	50 %	251792051
5019	NC_012913	TGG	2	6	240047	240052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251792051
5020	NC_012913	GCC	2	6	240066	240071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251792051
5021	NC_012913	T	7	7	240077	240083	0 %	100 %	0 %	0 %	251792051
5022	NC_012913	GTG	2	6	240147	240152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251792051
5023	NC_012913	GCC	2	6	240345	240350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251792051
5024	NC_012913	GAA	2	6	240424	240429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251792051
5025	NC_012913	TGAT	2	8	240460	240467	25 %	50 %	25 %	0 %	251792051
5026	NC_012913	GTG	2	6	240474	240479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251792051
5027	NC_012913	AGG	2	6	240491	240496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251792051
5028	NC_012913	GTG	2	6	240582	240587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251792051
5029	NC_012913	CTT	2	6	240632	240637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251792051
5030	NC_012913	GTT	2	6	240740	240745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251792051
5031	NC_012913	TTG	2	6	240749	240754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251792051
5032	NC_012913	T	6	6	240760	240765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_012913	AAT	2	6	240825	240830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251792052
5034	NC_012913	ATCA	2	8	240837	240844	50 %	25 %	0 %	25 %	251792052
5035	NC_012913	ACG	2	6	240862	240867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251792052
5036	NC_012913	CTT	2	6	240887	240892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251792052
5037	NC_012913	AAT	2	6	240903	240908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251792052
5038	NC_012913	TAAT	2	8	241013	241020	50 %	50 %	0 %	0 %	251792052
5039	NC_012913	CTT	2	6	241025	241030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251792052
5040	NC_012913	CTT	2	6	241040	241045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251792052
5041	NC_012913	TTA	2	6	241048	241053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251792052
5042	NC_012913	CGG	2	6	241088	241093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251792052
5043	NC_012913	CGC	2	6	241098	241103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251792052
5044	NC_012913	CAC	2	6	241377	241382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251792052
5045	NC_012913	GCAC	2	8	241393	241400	25 %	0 %	25 %	50 %	251792052
5046	NC_012913	TAA	2	6	241503	241508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251792052
5047	NC_012913	GCGG	2	8	241509	241516	0 %	0 %	75 %	25 %	251792052
5048	NC_012913	TCT	2	6	241543	241548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251792052
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5050	NC_012913	TAAA	2	8	241576	241583	75 %	25 %	0 %	0 %	251792052
5051	NC_012913	GGC	2	6	241599	241604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251792052
5052	NC_012913	CTT	3	9	241630	241638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251792052
5053	NC_012913	TCGC	2	8	241674	241681	0 %	25 %	25 %	50 %	251792053
5054	NC_012913	GCG	2	6	241689	241694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251792053
5055	NC_012913	CG	3	6	241702	241707	0 %	0 %	50 %	50 %	251792053
5056	NC_012913	GC	3	6	241785	241790	0 %	0 %	50 %	50 %	251792053
5057	NC_012913	GCT	2	6	241911	241916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251792053
5058	NC_012913	A	6	6	241961	241966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_012913	A	6	6	241973	241978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_012913	TCATT	2	10	242110	242119	20 %	60 %	0 %	20 %	251792054
5061	NC_012913	T	7	7	242172	242178	0 %	100 %	0 %	0 %	251792054
5062	NC_012913	GTT	2	6	242219	242224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251792054
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5065	NC_012913	AAT	2	6	242391	242396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251792054
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5067	NC_012913	AAT	2	6	242449	242454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251792054
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5071	NC_012913	GAT	2	6	242599	242604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251792054
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5074	NC_012913	TCA	2	6	242925	242930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251792054
5075	NC_012913	TGCC	2	8	242953	242960	0 %	25 %	25 %	50 %	251792054
5076	NC_012913	GCC	2	6	242963	242968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251792054
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5078	NC_012913	GACA	2	8	243065	243072	50 %	0 %	25 %	25 %	251792054
5079	NC_012913	TAAG	2	8	243124	243131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_012913	T	6	6	243209	243214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_012913	A	7	7	243247	243253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_012913	TGTC	2	8	243306	243313	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5083	NC_012913	GAA	2	6	243347	243352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251792055
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5090	NC_012913	TTCCG	2	10	243815	243824	0 %	40 %	20 %	40 %	251792055
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5092	NC_012913	TGG	2	6	243859	243864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251792055
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5094	NC_012913	TGA	2	6	243931	243936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251792055
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5099	NC_012913	CCG	2	6	244146	244151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251792055
5100	NC_012913	GA	4	8	244205	244212	50 %	0 %	50 %	0 %	251792055
5101	NC_012913	A	6	6	244212	244217	100 %	0 %	0 %	0 %	251792055
5102	NC_012913	T	6	6	244238	244243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_012913	TCT	2	6	244267	244272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_012913	A	7	7	244275	244281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_012913	GAA	2	6	244305	244310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_012913	AAT	2	6	244311	244316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_012913	GC	3	6	244339	244344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_012913	GTTT	2	8	244362	244369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_012913	CTTAT	2	10	244440	244449	20 %	60 %	0 %	20 %	251792056
5110	NC_012913	ATT	2	6	244497	244502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251792056
5111	NC_012913	TAA	2	6	244542	244547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251792056
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5118	NC_012913	ATT	2	6	245201	245206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251792056
5119	NC_012913	TGA	2	6	245298	245303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251792056
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5124	NC_012913	TTCA	2	8	245516	245523	25 %	50 %	0 %	25 %	251792056
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5126	NC_012913	ATT	2	6	245576	245581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251792056
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5128	NC_012913	ATG	2	6	245643	245648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251792056
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5131	NC_012913	TTA	2	6	245760	245765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251792056
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5135	NC_012913	ATA	2	6	246045	246050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251792057
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5146	NC_012913	A	6	6	246527	246532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5192	NC_012913	ATTT	2	8	248600	248607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5197	NC_012913	T	8	8	248773	248780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5198	NC_012913	TA	3	6	248794	248799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5199	NC_012913	AATT	2	8	248816	248823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5204	NC_012913	TTA	2	6	248959	248964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5235	NC_012913	TGAC	2	8	250411	250418	25 %	25 %	25 %	25 %	251792061
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5244	NC_012913	CTTG	2	8	250868	250875	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5245	NC_012913	T	7	7	250921	250927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_012913	CAT	2	6	250940	250945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5248	NC_012913	T	7	7	250982	250988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_012913	GAT	2	6	250993	250998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5252	NC_012913	ACC	2	6	251211	251216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251792062
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5254	NC_012913	ACA	2	6	251347	251352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251792062
5255	NC_012913	AC	3	6	251444	251449	50 %	0 %	0 %	50 %	251792062
5256	NC_012913	CGC	2	6	251459	251464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251792062
5257	NC_012913	AAC	2	6	251584	251589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251792062
5258	NC_012913	CGC	2	6	251663	251668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251792062
5259	NC_012913	CGA	2	6	251678	251683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251792062
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5262	NC_012913	ATA	2	6	251797	251802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251792062
5263	NC_012913	AT	3	6	251899	251904	50 %	50 %	0 %	0 %	251792062
5264	NC_012913	GCG	2	6	251914	251919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251792062
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5268	NC_012913	TAA	2	6	252112	252117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5269	NC_012913	GCAATA	2	12	252144	252155	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5270	NC_012913	TTA	2	6	252170	252175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5271	NC_012913	AGG	2	6	252253	252258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5272	NC_012913	GCAA	2	8	252278	252285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5273	NC_012913	AACC	2	8	252305	252312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5274	NC_012913	A	6	6	252334	252339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5275	NC_012913	A	6	6	252341	252346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5276	NC_012913	TAA	2	6	252386	252391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5277	NC_012913	A	6	6	252398	252403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5278	NC_012913	AATA	2	8	252435	252442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5279	NC_012913	AGT	2	6	252524	252529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251792063
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5286	NC_012913	TG	3	6	252897	252902	0 %	50 %	50 %	0 %	251792063
5287	NC_012913	GCG	2	6	252942	252947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251792063
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5289	NC_012913	TTA	3	9	252959	252967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251792063
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5291	NC_012913	GAA	2	6	253104	253109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251792063
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5322	NC_012913	GGTT	2	8	254631	254638	0 %	50 %	50 %	0 %	251792063
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5331	NC_012913	CGG	2	6	255111	255116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251792063
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5361	NC_012913	TAT	2	6	256800	256805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251792063
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5363	NC_012913	CAGG	2	8	256833	256840	25 %	0 %	50 %	25 %	251792063
5364	NC_012913	CAA	2	6	256851	256856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251792063
5365	NC_012913	CAC	2	6	256948	256953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251792063
5366	NC_012913	GTATGA	2	12	257246	257257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251792063
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5370	NC_012913	ATC	2	6	257371	257376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251792063
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5378	NC_012913	CTT	2	6	257823	257828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251792063
5379	NC_012913	GCG	2	6	257859	257864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251792063
5380	NC_012913	TTA	2	6	257866	257871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251792063
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5382	NC_012913	A	6	6	257970	257975	100 %	0 %	0 %	0 %	251792063
5383	NC_012913	TCC	2	6	257978	257983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251792063
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5400	NC_012913	TAA	2	6	258716	258721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5403	NC_012913	CTGA	2	8	258826	258833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5404	NC_012913	CTAT	2	8	258889	258896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5452	NC_012913	A	7	7	261434	261440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5453	NC_012913	A	6	6	261447	261452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5485	NC_012913	GA	3	6	262972	262977	50 %	0 %	50 %	0 %	251792070
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5489	NC_012913	T	8	8	263060	263067	0 %	100 %	0 %	0 %	251792070
5490	NC_012913	TGC	2	6	263083	263088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251792070
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5495	NC_012913	CACC	2	8	263427	263434	25 %	0 %	0 %	75 %	251792070
5496	NC_012913	GTT	2	6	263598	263603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251792070
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5499	NC_012913	TTG	2	6	263821	263826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251792070
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